hjemodomen

Hjemodomen, eller homeodomen, er en konservert DNA-bindingsdomene på omtrent 60 aminosyrer som forekommer i mange transkripsjonsfaktorer kalt homeobox-familien. Domenet er vanligvis en del av et større regulerende protein som styrer genuttrykk under utvikling.

Hjemodomenet er kjent for sin helix-turn-helix-struktur bestående av tre alfa-helikser; den tredje heliks fungerer som gjenkjennelsesheliks og binder til DNA i major groove, ofte til en kjerne-sekvens som inneholder TAAT eller beslektede motiv. Den N-terminale armen binder minor groove og bidrar til spesifisitet.

Homeobox-genene inneholder ofte en bevarte 180 bp region som koder for hjemodomenet, som i sin tur består av omtrent 60 aminosyrer. Dette domenet gir et regulerende protein som styrer kroppsplanleggning og andre utviklingsprosesser i ulike organismer.

Hjemodomen finnes i mange organismer, inkludert dyr, planter og sopp. De mest kjente familiene er Hox/Antennapedia, som spiller en nøkkelrolle i anterior-posterior-aksen utvikling. Hos vertebrater virker hjemodomen-proteiner ofte i samarbeid med cofaktorer som Meis/PBX for å utvide bindingsspesifisiteten. I planter finnes homeodomen i grupper som KNOX og HD-Zip-familier, som også styrer utviklingsprogrammer.

Mutasjoner i hjemodomenet eller i tilstøtende regulatoriske regioner kan føre til utviklingsmessige feil. Studier av hjemodomen har bidratt til forståelsen av hvordan et relativt lite DNA-bindingsdomene kan styre komplekse utviklingsprosesser.