entsyymiperheisiin

Ensyyymiperheet ovat ryhmiä entsyymejä, jotka ovat peräisin samasta evolutiivisesta juuresta tai joilla on yhteinen rakennemalli sekä usein sama katalyyttinen mekanismi. Perheet määritellään yhdistämällä useita todisteita: aminohapposekvenssien samankaltaisuus, kolmiulotteinen rakenne sekä aktiivisen keskuksen motifit, ja niillä on usein samanlaiset reaktiot tai saman suuntaisia substraatteja varten. Jäsenet voivat katalysoida samanlaisia reaktioita tai toimia läheisesti liittyvillä substraateilla.

Perheet ovat keskeisiä genomianalyysissä ja proteiinien annotoinnissa: kun uusi entsyymi havaitaan, sen perheen perusteella voidaan ennustaa sen toimintoja. EC-luokitus antaa reaktion tyypin, ja lisäksi perheet sekä alaperheet on merkitty tietokantoihin kuten Pfam, InterPro ja MEROPS. Homologian perusteella voidaan myös päätellä aktiivisia keskuksia ja mahdollisia substraatteja. Näiden työkalujen avulla tutkijat voivat tukea annotointia ja löytää potentiaalisia lääke- ja teollisuuskohteita.

Esimerkkejä tunnetuista entsyymiperheistä ovat seriiniproteaasien ryhmät sekä suuret oksidoreduktaasien ja hiilihydraattien käsittelyyn osallistuvat perheet. Perheiden säilyneet rakenteet ja aktiiviset keskukset heijastavat evoluutiota ja mahdollistavat sekä perusfysiologian että sovellustutkimuksen, kuten lääkekehityksen ja teollisten bioteknologisten prosessien kehittämisen.