clampproteiner

Clampproteiner är en familj ringformade proteiner som omsluter DNA och fungerar som processivitetsfaktorer för DNA-polymeraser under DNA-replikation. Genom att bilda en slät, cirkulär struktur runt dubbelsträngat DNA möjliggör de att polymeraset förflyttar sig längs matrisen utan att dissociera, vilket ökar replikationens effektivitet och kontinuitet.

Struktur och mekanism: Clampproteiner är ofta homomera eller heteromera ringar som öppnas och sätts runt DNA av särskilda clamp-loaders (klämmladdare) i en ATP-beroende process. I bakterier är ett välkänt exempel beta-klämman, medan eukaryoter använder PCNA (proliferating cell nuclear antigen). Clamp-loaders, såsom gamma-komplexet i bakterier och RFC (replication factor C) i eukaryoter, känner igen primers och replikationsgaffeln för att ladda klämman på DNA.

Funktioner utöver processivitet: Förutom att stabilisera polymerasen fungerar clampproteiner som plattformar för rekrytering av en rad replikerings- och reparationsfaktorer, inklusive ligaser, endonukleaser och translesionspolymeraser. Detta gör dem centrala för koordinering av DNA-syntes, skadereparation och DNA-checkpoints.

Betydelse och forskning: Clampproteiner är evolutionärt konserverade och studeras intensivt inom molekylärbiologi. Dysfunktion i relaterade vägar kan bidra till genomisk instabilitet; clampproteiner och deras laddare är också intressanta mål i forskning kring cancer och antibiotika.