autofluoresenssitilanteet
Autofluoresenssitilanteet ovat ilmiö, jossa kudos tai solu emittoi fluorescencea ilman lisättyä fluoroforia. Biologisissa kudoksissa endogeenisiä fluoroforeja ovat muun muassa NADH ja NADPH, FAD, lipofuskiini sekä kollageeni ja elastiini; porfyrinijohdannaiset voivat myös tuottaa signaalia. Näiden endogeenisten yhdisteiden fluoresenssi riippuu eksitaatiosta, emissiosäteilystä sekä ympäristön tekijöistä kuten pH:sta ja redox-tilasta.
Autofluoresenssi voi häiritä fluoresenssikuvausta ja analyysiä, koska taustasignaali voi peittää ulkoisten fluoroforejen signaalin tai virittää kvantitatiivisia
Hallinta ja erottelu tapahtuvat useilla keinoilla: valitaan eksitaatio- ja emissiospektri siten, että autofluoresenssi on mahdollisimman vähäistä;
Sovelluksia: autofluoresenssia hyödynnetään kliinisissä ja tutkimuksellisissa sovelluksissa esimerkiksi autofluoresenssi-endoskopiassa, jossa normaalin ja patologisen kudoksen kontrastia voidaan
Suunnittelu ja raportointi: tutkimuksessa on tärkeää dokumentoida taustasignaalin mittaus, kontrollit ja standardointi sekä valita kuvausasetukset siten,