Yksittäissoluproteomiikka

Yksittäissoluproteomiikka on joukko tekniikoita, joiden avulla tutkitaan proteiinien koostumusta yksittäisissä soluissa. Toisin kuin perinteinen proteomiikka, joka analysoi suuria solumääriä ja tuottaa keskimääräisiä proteiiniprofiileja, yksittäissoluproteomiikka paljastaa solujen välisiä eroja ja yksittäisten solujen heterogeenisyyttä. Tämä on erityisen tärkeää, kun tutkitaan monimutkaisia kudoksia, kuten aivoja tai syöpäkasvaimia, joissa solujen toiminta ja ominaisuudet voivat vaihdella merkittävästi.

Menetelmät yksittäissoluproteomiikassa perustuvat usein korkean herkkyyden massaspektrometriaan tai vastaaviin analyyttisiin lähestymistapoihin. Näiden avulla voidaan tunnistaa ja kvantifioida tuhansia proteiineja jopa yhdestä solusta. Tyypillisesti analyysi alkaa solujen eristämisellä, jonka jälkeen proteiinit vapautetaan, pilkotaan peptideiksi ja analysoidaan massaspektrometrillä. Saatu data vaatii kehittyneitä bioinformatiivisia työkaluja tulkintaa varten.

Yksittäissoluproteomiikan sovellusalueita ovat muun muassa syövän mekanismien ymmärtäminen, neurodegeneratiivisten sairauksien tutkimus, kehitysbiologia sekä lääkekehitys. Se auttaa tunnistamaan uusia biomarkkereita ja terapeuttisia kohteita, jotka saattavat jäädä huomaamatta perinteisillä menetelmillä. Haasteita menetelmässä ovat muun muassa näytteen pieni määrä, prosessoinnin aikana tapahtuva proteiinien hävikki ja analyysin monimutkaisuus. Teknologian kehittyessä yksittäissoluproteomiikan tarkkuus ja kattavuus paranevat jatkuvasti.