Yksittäissoluproteomiikan

Yksittäissoluproteomiikka on proteomiikan ala, joka keskittyy yksittäisten solujen proteiinien tunnistamiseen ja kvantifiointiin. Perinteinen proteomiikka analysoi tyypillisesti suuria solupopulaatioita, mikä voi peittää alleen solujen väliset erot ja yksittäisten solujen proteiinin ilmentymisen vaihtelut. Yksittäissoluproteomiikka tarjoaa korkeamman resoluution, mahdollistaen heterogeenisten solupopulaatioiden, kuten kudosten tai syöpäkasvainten, analysoinnin yksittäisten solujen tasolla.

Menetelmät yksittäissoluproteomiikassa vaihtelevat, mutta ne perustuvat usein solujen eristämiseen ja sen jälkeen massaspektrometriaan tai immunokemiallisiin menetelmiin proteiinien tunnistamiseksi. Solujen eristäminen voidaan toteuttaa esimerkiksi virtaussytometrialla, soluloukuilla tai mekaanisilla menetelmillä. Proteiinien tunnistaminen ja kvantifiointi yksittäisistä soluista on haastavaa, koska proteiinimääriä on hyvin vähän. Kehitetyt menetelmät pyrkivät maksimoimaan proteiinien talteenoton ja herkkyyden.

Yksittäissoluproteomiikan sovellusalueita ovat muun muassa syövän tutkimus, kehitysbiologia, immunologia ja neurotiede. Sen avulla voidaan tunnistaa uusia solutyyppejä, ymmärtää solujen erilaistumisen mekanismeja ja tutkia harvinaisia solupopulaatioita, jotka saattavat olla merkityksellisiä sairauksien patogeneesissä. Menetelmien kehittyessä yksittäissoluproteomiikka tarjoaa entistä tarkempaa tietoa biologisten järjestelmien monimutkaisuudesta.