Virusgrupper

Virusgrupper är kategorier som används för att organisera och jämföra virus utifrån gemensamma egenskaper. Denna struktur underlättar forskning, övervakning och kommunikation om virala egenskaper, spridning och replikationsstrategier. Grupperna kan baseras på genomtyp, kapsid- och höljesegenskaper samt hur viruset lever och replikerar.

En central officiell klassificering kommer från ICTV (International Committee on Taxonomy of Viruses). ICTV tillhandahåller en hierarki som vanligtvis omfattar ordning, familj, släkte och art. Denna taxonomi speglar biologiska egenskaper och evolutionära relationer mellan virus och uppdateras när ny kunskap framkommer.

Baltimoreklassificeringen är ett komplement som kategoriserar virus i sju klasser efter genometyp och hur mRNA produceras under replikationen. Klass I till VII omfattar dsDNA-virus, ssDNA-virus, dsRNA-virus, (+)ssRNA-virus, (-)ssRNA-virus samt virus med omvänd transkription (retrovirus och hepatadnavirus). Klassen beskriver därmed i vilken form virusets genetiska material finns och hur det används för proteinsyntes.

Andra vanliga kriterier vid gruppindelning är hölje (om viruset har ett lipidmembran) samt kapsidets symmetri (t.ex. icosahedral eller helikal), samt om genomet är segmenterat. Vissa grupper dominerar bland virus som infekterar djur, växter eller bakterier (bakteriofager). Virusgrupper är dynamiska och uppdateras när nya virus upptäcks eller ny kunskap om deras funktioner framkommer. Exempel på välkända familjer är Herpesviridae, Coronaviridae, Orthomyxoviridae och Retroviridae.