Serotyyppijoukkoja

Serotyyppijoukot ovat bakteeri- tai virussukujen sisäisiä ryhmiä, joita erotetaan toisistaan pinnalla olevien antigeenien perusteella. Serotyyppijoukot määritellään serologisilla testeillä, joissa käytetään antiserumia tunnistamaan tiettyjä antigeenejä, kuten O-, K- ja H-antigeenejä. Yksi serotyyppijoukko koostuu niistä serotyypeistä, jotka jakavat samanlaisen antigenisen rakenteen tai kuuluvat samaan serologiseen järjestelmään.

Serotyyppijoukkoja käytetään laajalti epidemiologiassa ja taudinvalvonnassa. Niiden avulla voidaan jäljittää tartunnanlähteitä, seurata epidemioiden etenemistä sekä suunnitella rokotteita ja diagnostiikkaa. Esimerkkejä ovat Salmonella enterica -kannan lukuisat serovarot sekä Escherichia coli -kannan O- ja H-antigeenien perusteella tehtävät serogroup- ja serotyyppiluokitukset. Myös Neisseria meningitidis ja Streptococcus pneumoniae määritellään usein serotyypeillä, joiden perusteella epidemiologia ja rokotestrategiat kohdistetaan.

Menetelmät: perinteisesti serotyyppejä erotetaan serologisilla menetelmillä, kuten slide- tai putkagglutinaatiolla sekä ELISA-testeillä. Nykyisin yleistyvät molekulaariset menetelmät, kuten PCR-pohjaiset serogroup- ja serotype-määrittelyt sekä whole-genome sequencing, voivat täydentää tai korvata perinteiset menetelmät.

Rajoitteet: serotyypityksessä voi esiintyä ristikkäisreaktioita, antigeeninen vaihtelu ja joidenkin kantojen epätyypillisyys (non-typeable). Eri maantieteelliset ohjelmat käyttävät hieman erillisiä serotyppi- ja serogroup-järjestelmiä, minkä vuoksi tuloksia tulkitaan usein yhdessä genotyyppisen luokittelun kanssa.

---