STRprofilointi

STRprofilointi, eli STR-profilointi, on DNA-analyysin menetelmä, jolla tuotetaan yksilöllinen DNA-profiili lyhyiden toistojaksojen (short tandem repeats, STR) perusteella. STR-loci ovat perimässä toistuvia jaksoja, joiden toistomäärät vaihtelevat yksilöittäin. Profiili muodostuu useiden STR-lokien alleelisista arvoista, ja siihen sisältyy usein myös sukupuolen erottamiseen liittyvä loki.

Menetelmällisesti STRprofilointi perustuu laboratoriossa käytettäviin PCR-tekniikoihin, joilla valitut STR-lokit monistetaan. PCR-reaktiossa kootaan toistuvia jaksoja, ja lopullinen analyysi tapahtuu capillary-elektroforeesilla, jossa fragmenttien pituudet mitataan. Tuloksena saadaan alleelikirjoitus jokaiselle lokille; useimmat laboratoriot käyttävät useita STR-lokeja samaan profiiliin. Yhteenvetona muodostuu yksilöllinen profiili, jota verrataan toisiin näytteisiin, viiteprofiileihin tai epäiltyyn näytteeseen.

Käyttökohteet ovat pääosin forensiikassa: STR-profiiloita käytetään rikostutkinnassa näytteiden identifiointiin, kadonneiden tai katastrofiriskialtisteiden henkilöllisyyden varmistamiseen sekä oikeuslääketieteellisessä tunnistuksessa. STR-profilointi tukee päätöksentekoa todennäköisyyksien ja tilastollisten arvojen avulla.

Rajoitteisiin kuuluu näytteen laatu ja määrä: sekaiset tai vanhentuneet näytteet voivat johtaa osittaisiin tai epävarmoihin profiileihin. Myös sekoitukset ja biologinen monimuotoisuus voivat hankaloittaa tulkintaa. Lisäksi tulkinta perustuu populaatiofrekvensseihin ja satunnaisvastavuuden arviointiin, mikä vaatii asianmukaisia tilastollisia malleja.

Tietosuoja ja etiikka ovat olennaisia: STR-profiilit sisältävät periytyvää geneettistä tietoa ja niitä käsitellään säädellysti; lainsäädäntö, suostumukset sekä tietoturva ohjaavat näytteiden keräämistä, tallentamista ja käyttöä.