Rhoabhängige

Rhoabhängige Terminierung ist ein Mechanismus der Transkriptionsbeendigung in Bakterien, der durch das Rho-Protein vermittelt wird. Rho ist ein hexamerses RNA-Helikase-Protein, das an naszierende RNA an bestimmten Rut-Stellen bindet und ATP-abhängig entlang der RNA in Richtung der RNA-Polymerase bewegt. Wenn Rho die RNA-Polymerase erreicht, typischerweise an einer pausenbedingten Stelle, kommt es zum Abbruch des Transkriptionskomplexes und zur Freisetzung der RNA.

Rut-Stellen sind in der Regel cytosinreich, wenig strukturierte Abschnitte der wachsenden RNA, die das Binden von Rho erleichtern. Die Termination hängt oft von der Kooperation mit der RNA-Polymerase und anderen Faktoren, wie NusG, der in vielen Bakterien die Effizienz der Rho-vermittelten Termination beeinflusst, ab.

Im Gegensatz zur Rho-unabhängigen Terminierung, bei der eine intrinsische Terminatorsequenz eine Hairpin-Struktur gefolgt von Uridin-Basen bildet, benötigt die Rho-abhängige Terminierung keine solche intrinsische Struktur. Sie ist stattdessen abhängig von Rho und der Fähigkeit, den Transkriptionskomplex durch Abdriften oder Entknüpfung zu lösen.

Verbreitung und Bedeutung: Rhoabhängige Terminierung tritt in vielen Bakterienarten auf und dient der feingranulierten Regulation der Genexpression, der Verhinderung unerwünschter Transkriptionsweiterführung und der Organisation von Operon-Strukturen. Die Mechanismen und Einzelheiten der Terminierung werden aktiv erforscht, mit laufenden Studien zu den genauen Interaktionsmodellen zwischen Rho, RNA und RNA-Polymerase.