Polypeptidiketjuissa

Polypeptidiketjuissa viittaa ketjuihin, jotka muodostuvat aminohapoista peptidisidosten välityksellä. Nämä ketjut ovat proteiinien perusrakenteita. Jokainen aminohappo on yhdistetty seuraavaansa peptidisidoksella, joka on kovalenttinen sidos, muodostuen karboksyyliryhmän ja aminoryhmän välille. Tämä prosessi tunnetaan kondensaatioreaktiona, jossa vapautuu vesimolekyyli.

Polypeptidiketjun rakenne on lineaarinen, ja se alkaa aminopäätyllä (jossa on vapaa aminoryhmä) ja päättyy karboksyylipäähän (jossa on vapaa karboksyyliryhmä). Aminohappojen järjestys polypeptidiketjussa, eli sen primaarirakenne, on ratkaisevan tärkeä proteiinin lopullisen muodon ja toiminnan kannalta. Tämän järjestyksen määrää DNA:n geneettinen koodi.

Yhden tai useamman polypeptidiketjun taittuminen kolmiulotteiseksi rakenteeksi luo toiminnallisen proteiinin. Tämän taittumisen mahdollistavat aminohappojen sivuketjujen väliset vuorovaikutukset, kuten vetysidokset, ionisidokset ja hydrofobiset vuorovaikutukset. Proteiinin toiminta riippuu sen tarkasta kolmiulotteisesta muodosta. Polypeptidiketjuissa ovat siten proteiinien rakennuspalikoita, joiden järjestyksellä ja vuorovaikutuksilla on perustavanlaatuinen merkitys biologisissa prosesseissa.