Peptidaaseja

Peptidaaseja ovat entsyymejä, jotka katalysoivat peptideiden ja proteiinien peptidisidosten hydrolyysi. Ne kattavat endopeptidaasit, jotka katkaisevat sidoksia peptideketjun sisäosista, sekä exopeptidaasit, jotka poistavat aminohappoja ketjun päistä. Yleiskäsitteessä peptidaasit (proteaasit) viittaa laajaan entsyymeryhmään, joka vastaa proteiinien pilkkomisesta, proteiinikierrätyksestä ja proteomien säätelystä.

Peptidaasit jaetaan toimintaperiaatteen mukaan pääryhmiin: seriiniproteaasit, kysteiiniproteaasit, aspartaattiproteaasit sekä metallo-/metalloproteaasit. Jokaisella ryhmällä on omat aktiivikeskuksensa; esimerkkeinä seriiniproteaasit (kuten trypsiini ja chimotrypsiini) hyödyntävät seriinialkion katalyysissä, kysteiiniproteaasit käyttävät kysteiiniä, aspartaattiproteaasit kuten jotkin ruoansulatusentsyymit käyttävät aspartaattia, ja metalloproteaasit tarvitsevat metallin, usein sinkin, toimintansa kannalta.

Ruoansulatuskanavassa peptidaasit pilkkovat ravinnosta saatavaa proteiinia. Solunsisäisessä kierrätyksessä keskeisiä ovat proteasomi sekä kysteiiniproteaasit kuten kalpaasit; kudoksissa vaikuttavat lisäksi matrixmetalloproteaasit.

Lääketieteessä peptidaasit ovat tärkeitä kohteita: HIV-1 proteaasien estäjät ovat käytössä HIV-hoidoissa. Metalloproteaasi-inhibiittoreita ja muita proteaasi-inhibiottoreita tutkitaan syövän, tulehduksellisten sairauksien sekä joidenkin neurodegeneratiivisten tilojen hoidossa. MEROPS-tietokanta luokittelee peptidaasit rakenteen ja mekanismin mukaan.