Koimmunoprecipitointi

Koimmunoprecipitointi on laboratoriomenetelmä, jolla pyritään tutkimaan ja selvittämään proteiinien vuorovaikutuksia ja komplekseja. Tässä menetelmässä käytetään spesifisiä anti-proteiinivasta-aineita, jotka sitoutuvat tiettyihin proteiineihin näytteessä. Antikehän avulla muodostuu proteiini-vasta-aine-kompleksi, joka voidaan eristää ja puhdistaa näytteen muista molekyyleistä.

Menetelmä alkaa näytteen valmistelulla, jossa soluja tai kudoksia hajotetaan ja saadaan esille proteiineja. Spesifi vasta-aine lisätään näytteeseen, jolloin se sitoutuu kohdeproteiniin. Kompleksi erotetaan käyttämällä esimerkiksi proteiini-G-levyjä tai magneettinaruja, jotka sitoutuvat vasta-aineeseen. Näin saadaan puhdistettua kohdeproteiinia ja siihen liittyviä proteiineja. Seuraava vaihe on analysoida räätälöidyllä tekniikalla, kuten Western blotilla, mitkä proteiinit ovat liittyneet tai muodostaneet kompleksi.

Koimmunoprecipitointi on keskeinen työkalu proteiinien vuorovaikutusten tutkimisessa, esimerkiksi solutason signaalinvälitteisten reaktioiden selvittämisessä. Se auttaa tunnistamaan ja vahvistamaan proteiinien välisiä liitoksia ja vuorovaikutusverkostoja solussa. Menetelmää on sovellettu myös lääketieteellisessä tutkimuksessa, esimerkiksi tautimekanismien ymmärtämisessä ja biomarkkerien etsinnässä. Menetelmän haasteita ovat spesifisyyden ja taustasignaalien minimointi sekä siinä käytettyjen vasta-aineiden laatu.