Genomloppstiden

Genomloppstiden är ett svenskt begrepp som saknar en entydig, universell definition och används i olika sammanhang inom genomik och evolutionsforskning. Inom laboratorie- och biotekniska miljöer kan termen referera till den totala tiden för en fullständig genome sequencing-run, det vill säga från provinsamlning och bibliotekspreparation till sekvensering och bearbetning av data. Denna tidsram varierar kraftigt mellan plattformar, antal prover och önskat djup av täckning.

I ett evolutionärt eller populationsteknologiskt perspektiv kan genomloppstiden beskriva den förväntade varaktigheten som ett visst genom eller en viss genetisk konfiguration upprätthålls i en population innan den ersätts av nya varianter genom mutation, selektion eller genetisk drift. Denna användning fungerar som ett begreppsligt mått på genome turnover eller genomsstabilitet över generationer och kan skilja sig mellan arter, miljöer och populationsstrukturer.

Eftersom termen ofta är kontextberoende används den generellt som ett övergripande redskap eller komplement till mer standardiserade mått inom respektive område. För tydlighet bör man i varje användning specificera vad som avses med genomloppstid och vilka metoder eller antaganden som ligger till grund. Relaterade begrepp inkluderar genome sequencing, mutationshastighet, genetisk drift och populationsomsättning.

---