primaarstruktuuris

Primaarstruktuur on biopolümeeride lineaarne monomeeride järjestus. Valkude puhul kirjeldab see aminohappe järjestust polüpeptiidiahelas, mis on ühendatud peptiidsidemetega alates N-terminusest kuni C-terminuseni. Primaarstruktuuri määrab geeni järjestus, mis kodeerib vastava valgu aminohappejada ning mida määravad transcription ja translation protsessid. Primaarstruktuuri kirjeldatakse täpse aminohappe nimede ja järjestusega, sealhulgas vajadusel kõrvaltoimeid ja modifikatsioone.

Primaarstruktuur mängib keskset rolli valkude omaduste ja funktsiooni määramisel. Järjestus otseselt mõjutab polüpeptiidi füüsikokeemilisi omadusi, stabiilsust ja lahustuvust ning võimaldab sekundaarsete ja kõrgemate struktuuride tekkimist. Muutused primaarstruktuuris, näiteks mutatsioonid, võivad muuta valgu foldumist, funktsiooni või stabiilsust ning seetõttu olla seotud haigustega. Üldiselt on primaarstruktuur esimene samm valgu bioloogilises rollis ning see on geneetilise informatsiooni ja valgu biokeemiliste omaduste vahekoht.

Nukleiinhapete kontekstis tähistab primaarstruktuur nukleotiidide järjestust DNA või RNA ahelas. DNA primaarstruktuur on 5'→3' suunalise järjestusega süsiniku- ja süsivesikupõhiste suhkrute ning fosforhape sidumistega, mis kodeerib geneetilise informatsiooni. Nukleotiidide järjekord määrab geenide koodi ja RNA transkriptsiooni ning lõppkokkuvõttes toimub tähistatud valkude süntees. Primaarstruktuuri tundmine on aluseks valkude funktsiooni ja nukleiinhapete bioloogilise rolli mõistmisel.