polypeptidkæden

En polypeptidkæde er en lang polymer af aminosyrer forbundet med peptidbindinger. Peptidbindingerne dannes ved en kondensationsreaktion, hvor et vandmolekyle fjernes mellem carboxylgruppen af én aminosyre og aminogruppen af en anden. Den resulterende kæde har en N-terminal (med en fri aminogruppe) i den ene ende og en C-terminal (med en fri carboxylgruppe) i den anden. Rækkefølgen af aminosyrer i polypeptidkæden bestemmes af genetisk information og er kendt som den primære struktur. Denne sekvens er afgørende for kædens tredimensionelle foldning og dermed dens funktion. En polypeptidkæde kan folde sig spontant til en funktionel form, som ofte er et protein, eller den kan kræve hjælp fra chaperoner. Afhængigt af aminosyresammensætningen og de interaktioner, der opstår, kan en polypeptidkæde opnå sekundære strukturer som alfa-helixer og beta-plader, og yderligere foldning resulterer i tertiære og kvartære strukturer. Når en polypeptidkæde er færdig med at blive syntetiseret på ribosomet, kan den gennemgå post-translationelle modifikationer, som yderligere kan ændre dens egenskaber og funktion. Antallet af aminosyrer i en polypeptidkæde kan variere fra få til tusindvis. Når en proteinstruktur består af flere polypeptidkæder, kaldes de ofte subenheder.