molekyyliprofiilit

Molekyyliprofiilit ovat kokonaisuus molekyylin rakennetta ja ominaisuuksia kuvaavia piirteitä, joita käytetään kemian, lääkeainekehityksen ja materiaalitieteen konteksteissa. Profiilit voivat muodostua sekä kokeellisista mittauksista että laskennallisista kuvaajista ja ne mahdollistavat molekyylien vertailun, luokittelun ja ennustamisen.

Profiiliin kuuluu sekä rakenteellisia että fysikaalis-kemiallisia kuvaajia. Rakenteellisia piirteitä ovat atomien ja sidosten järjestys, fragmenttien esiintyminen sekä ringkierrokset. 2D-deskriptorit mittaavat esimerkiksi hydrattoisuutta ja polaarisuutta (kuten logP, logS, yhdistetysten lukumäärä, H-bond donors ja acceptors, topological polar surface area), sekä rotaattoreiden määrä ja rengasrakenteet. 3D-deskriptorit huomioivat kolmiulotteisen muodon ja konformaatio-tilanteet. Lisäksi profiileihin voidaan sisällyttää spektroskopisia tai kemiallisia tunnisteita, kuten SMILES- tai InChI/Käytä InChIKey -tunnisteita sekä kolmiulotteisia koordinaattitietoja. Toisinaan mukaan lisätään biologisen aktiivisuuden tai ADME/Tox-arvioiden kaltaisia ennusteita.

Käyttötarkoitukset kattavat samankaltaisuuden haun ja klusteroinnin, QSAR-mallien ja dock‑ingin tukemisen, lääkeaineiden optimoinnin sekä kirjastoarkkitehtuurin suunnittelun. Profiilit vaativat standardointia ja valvottua laadunvarmistusta, sillä tulosten luotettavuus riippuu datan laadusta ja yhdenmukaisesta esittämisestä.

Esimerkkejä ovat molekyylin paino, logP, TPSA, H-bond donors/acceptors, rotatable bonds sekä fingerprintit (esim. MACCS/ECFP) ja ennusteet kuten solubilius ja toksisuus.