molekyltyp

Molekyltyp är ett begrepp som används för att beskriva och classifica molekyler utifrån centrala strukturella eller funktionella egenskaper. Begreppet är ofta kontextberoende och används för att förenkla kommunikation inom kemi, biokemi, farmakologi och kemoinformatik genom att gruppera molekyler som liknar varandra i beteende eller funktion.

En molekyltyp kan definieras utifrån olika kriterier. Funktionella grupper (t.ex. alkoholer, aldehyder, karboxylsyror, aminer) är vanliga radar för klassificering. Även den kolstruktur molekylen bygger på (linjär, grenad, ringad), stereokemi (kirkalska kontra achirala molekyler), samt jonisering och laddning kan avgöra molekyltypen. I farmakologi används ofta pharmacophore-liknande egenskaper – exempelvis närvaro av donator-/acceptor-grupper, aromatiska ringar och laddade grupper – för att beskriva en molekyltyp som är relevant för biologisk aktivitet.

Exempel på molekyltyper är alkoholer, fenoler, aldehyder, ketoner, karboxylsyror, aminer, etrar, samt större klasssystem som aromatiska föreningar eller polyfunktionella molekyler med flera funktionella grupper. Inom biokemi kan även biologiskt relevanta molekyltyper inkludera nukleotider, lipider eller aminosyror i deras typiska funktionella sammanhang.

Användning och betydelse. Molekyltyper används i databaser och kemoinformatik för att organisera och söka bland kemikalier, vid QSAR-studier och i likhetsbaserad screening. De underlättar förutsägelser av fysikaliska egenskaper och potentiell biologisk aktivitet, samt hjälper till att kommunicera vilka generella egenskaper en substans har. Begränsningar uppstår eftersom gränser mellan typer kan vara flytande och en molekyl kan tillhöra flera typer beroende på kontext eller tautomerism.