koloniemäärän

Koloniamäärä on mikrobiologian käsite, joka kuvaa näytteessä muodostuvien elinkykyisten kolonioiden määrää kasvatettaessa näyte sopivalla kasvualustalla. Yleisesti koloniamäärä ilmoitetaan yksikköinä kolonioita per millilitra (CFU/mL) tai kolonioita per gramma (CFU/g). Koloniamäärää käytetään arvioimaan näytteen kontaminaation astetta sekä viljeltyjen solujen määrää.

Mittaus tapahtuu tavallisesti plakount- tai levitysmittauksena. Näyte laimennetaan sarjassa ja levitetään kasvatusalustoille, kuten agarille. Inkuboinnin jälkeen lasketaan näkyvät koloniat tietyn alueen tai koko levän perusteella. Tulokset esitetään CFU/mL tai CFU/g sekä ilmoittamalla käytetty laimennus ja kasvatusolosuhteet.

Tulosten luotettavuutta heikentävät näytteenotto ja -käsittely sekä solujen taipumus agglomeroitua, kasvualusta sekä inkubaatioajan ja -lämpötilan vaihtelut. Koloniat voivat saada alkunsa yhdestä solusta tai useammasta, mikä vaikuttaa arvoon ja sen tulkintaan.

Koloniamäärää käytetään elintarvike- ja vesitarkkailussa, kliinisessä mikrobiologiassa sekä tutkimus- ja kehitystyössä. Sillä arvioidaan kontaminaatioita, desinfiointimenetelmien tehokkuutta sekä tuotteen tai prosessin laatuvaatimusten noudattamista.

Koloniamäärä mittaa elinkykyisiä ja jakautumaan kykeneviä soluja, ei kaikkia soluja tai kuolleita soluja. Siksi CFU-arvot ovat likiarvoja, joita voidaan parantaa useilla menetelmillä ja tilastollisilla laskentatavoilla (esim. Poisson-jakauma).

Kirjallisuudessa koloniemäärän rinnalla käytetään myös muita mittausmenetelmiä, kuten virtaussytometria ja qPCR, jotka voivat antaa lisätietoa solujen kokonaismäärästä tai geneettisestä materiaalista, mutta eivät aina suoraan mittaa elinkykyisiä soluja.