dideoksinukleotideja

Dideoksinukleotidit ovat nukleotidien johdannaisia, joissa on epätavallinen ominaisuus. Nukleotidi koostuu tyypillisesti sokkerista, fosfaattiryhmästä ja typpipitoisesta emäksestä. Dideoksinukleotidi eroaa tavallisesta deoksinukleotidistä siten, että sen sokerirenkaan 3'-hiiliatomista puuttuu hydroksyyliryhmä. Tämä puuttuva hydroksyyliryhmä on ratkaiseva DNA:n synteesissä. DNA-polymeraasi, entsyymi, joka rakentaa uusia DNA-juosteita, lisää uusia nukleotideja kasvavaan juosteeseen muodostamalla fosfodiesterisidoksen edellisen nukleotidin 3'-hydroksyyliryhmän ja uuden nukleotidin fosfaattiryhmän välille. Koska dideoksinukleotidissä ei ole 3'-hydroksyyliryhmää, DNA-polymeraasi ei voi lisätä uutta nukleotidia sen jälkeen, kun dideoksinukleotidi on liittynyt juosteeseen. Tämä katkaisee DNA-ketjun kasvun. Tätä ominaisuutta hyödynnetään useissa bioteknologisissa sovelluksissa. Tunnetuin on Sangerin sekvensointimenetelmä, jota kutsutaan myös dideoksi-menetelmäksi. Tässä menetelmässä käytetään dideoksinukleotidien seosta, joista jokaisella on eri fluoresoiva merkki. Kun DNA:ta replikoidaan dideoksinukleotidien läsnäollessa, reaktio pysähtyy satunnaisissa kohdissa, kun dideoksinukleotidi lisätään. Eri pituiset DNA-fragmentit, jotka päättyvät tiettyyn dideoksinukleotidiin, voidaan sitten erotella ja analysoida, mikä paljastaa alkuperäisen DNA-sekvenssin. Dideoksinukleotidejä käytetään myös antiviraalisissa lääkkeissä, kuten didanosiinissa (ddI), joka estää viruksen DNA:n replikaatiota.