STRpohjaisia

STRpohjaisia viittaa DNA-analyyseihin, menetelmiin ja tulkintoihin, jotka perustuvat lyhyisiin toistostruktuureihin DNA:ssa, eli STR-merkkeihin (short tandem repeats). STR-loci ovat huomattavan polymorfisia yksilöiden välillä, mikä antaa niille korkean yksilöllisyys- ja erotuskyvyn. Väestötasolla STR-tutkimus kuvaa esiintyvyyksiä ja geneettistä rakennetta.

Tyypillisesti STR-pohjaisessa genotyyppauksessa valitaan useita STR-lokeja, joista jokaisella on vaihtelevan pituisia toistosilmukoita. DNA-osa poistetaan ja STR-loci PCR-amplicitaan, minkä jälkeen tulokset erotellaan kapillaarielektroforeesilla ja alleelipituudet määritellään. Tuloksena syntyy STR-profiili, joka koostuu yksittäisten alleelien tunnisteista ja joita voidaan verrata sekä yksilöiden välillä että toistuvasti laboratorioissa.

Sovellukset ja standardit: STR-pohjaisia menetelmiä käytetään laajasti forensisessä genetiikassa yksilöiden tunnistamiseen, sukulaisuussuhteiden selvittämiseen sekä rikostutkintaan. STR-profiileja ja standardeja hallitaan kansainvälisesti: CODIS- ja ISFG-työryhmien suositukset sekä laboratorion omat kumppanuudet mahdollistavat tulosten vertailun eri laboratorioiden välillä.

Edut ja rajoitukset: STR-merkit tarjoavat korkean tunnistettavuuden ja sopivat pienillekin hapetroille. Haasteita ovat sekoittuneet näytteet, mahdolliset null-alleelit sekä DNA:n hajoaminen, joka voi rajoittaa suurimpien tai harvinaisimpien loci-käyttöä. STR-pohjaiset menetelmät kehittyvät jatkuvasti, mutta standardointi on keskeistä tulosten vertailtavuuden takaamiseksi.