RNAprosessoinnissa

RNAprosessointi tarkoittaa solujen tapahtumien kokonaisuutta, jolla esiaste-RNA:sta muokataan toimivia RNA-molekyylejä. Prosessointi tapahtuu pääasiassa eukaryooteissa tumassa ja sitä ohjaavat monet proteiinit sekä RNA-proteiini-komplekssit. Prosessi määrittelee, millainen tuotettu RNA lopulta toimii solussa.

Yleisimmät tapahtumat liittyvät mRNA:n muokkaukseen. Ennen ifuutta RNA:lle muodostetaan 5'-päähän kapseli (5' cap) ja 3'-päähän poly(A)-häntä, mikä suojaa RNA:ta sekä helpottaa sen käännöstapaa. Esiasteen intronit poistetaan spliceosome-komplekseja hyödyntäen. Splicing voi olla perusmallin mukaista tai vaihtoehtoista, mikä lisää proteiinivarianteja yhdestä geenistä. Lisäksi RNA-editing, kuten A-to-I tai C-to-U muokkaukset, voi muuttaa koodia tai RNA:n toimintaa.

Erityyppiset RNA-molekyylit syntetisoidaan ja muokataan eri tavoin. TRNA:n ja rRNA:n kypsyminen etenee esiasteiden pilkkomisella ja lopulta tunnistetulla muokkauksella. TRNA:lla on usein 5' ja 3' päiden käsittely sekä CCA-jatkenteen lisääminen, kun taas rRNA vaatii monimutkaisia pilkkomis- ja muokkausvaiheita sekä snoRNP-entsyymejä.

Pienemmillä RNA-ryhmillä, kuten mikro-RNA:lla (miRNA) ja siRNA:lla, on oma biogeneesi: pri-miRNA muodostuu nucleusssa, käsittely Drosha-/DGCR8-komplekseilla, pre-miRNA kuljetetaan kiertorataa ulos tumaan exportin-5:n avulla, ja Dicer-entsyymi muokkaa siitä toimiva ohjain-RNA, joka liittyy RISC-kompleksiin. PiRNA:t ja muut pienet RNA-moryt voivat edistää transposonien hallintaa ja geenejä säätelevien mekanismien toimintoja.

Export ja laadunvalvonta kuuluvat olennaisesti prosessointiin. Kypsyneet RNA:t siirretään tumasta sytoplasmaan tumaporttien ja exportinien avulla. Laadunvalvontamekanismit, kuten nonsense-mediated decay (NMD), hajottavat virheellisiä transkripteja ennen niiden käännöstä. RNAprosessointi on siis keskeinen säätelevä vaihe geenien ilmentymässä.