RNAmetylaatio

RNAmetylaatio on RNA:n nukleotideihin lisättyjen metyyliryhmien muodostama säätelymuoto, joka kuuluu epitranskriptomiseen sääntelyyn. Modifikaatioita esiintyy sekä koodatulla mRNA:llä että rRNA- ja tRNA-molekyyleissä sekä joidenkin ei-koodaavien RNA-tyyppien osalta. Ne voivat vaikuttaa RNA:n käsittelyyn, vakauteen, kuljetukseen ja translikaation tehokkuuteen sekä lukutapaan, ilman DNA:n muutosta.

Yleisimmät sisäiset modifikaatiot ovat N6-metyyladenosiini (m6A), 5-metyylisytiidiini (m5C) sekä N1-metyylianosiini (m1A). m6A on laajimmin tutkittu sisäinen modifikaatio. Cap-alueen metylaatioon liittyy 7-metyyliguanosiini (m7G). Lisäksi on 2'-O-metylaatio ja cap-proksimaaliset modifikaatiot, jotka vaikuttavat lukemiseen ja tulkintaan. Muita modifikaatioita esiintyy sekä tietyissä RNA-ryhmissä että eri soluryhmissä.

RNA-metylaation kirjoittajat (writers) koostuvat muun muassa METTL3–METTL14 -monomeeristä sekä lisäkomponentteja kuten WTAP, VIRMA ja ZC3H13. Demetylaatioa suorittavat erasers, kuten FTO ja ALKBH5. Lukijoita (readers) ovat YTHDF1–3, YTHDC1 sekä IGF2BP-perheen jäsenet, jotka tunnistavat m6A-modifikaatioita ja vaikuttavat lukemiseen, stabiilisuuteen sekä translokaation säätelyyn.

Biologisesti RNA-metylaatio liittyy moniin solun prosesseihin, kuten kehitykseen, solueroihin ja immuunivasteisiin, sekä sen häiriöt voivat olla yhteydessä syöpään ja muihin sairauksiin. Tutkimusmenetelmät kuten MeRIP-seq/m6A-seq, miCLIP sekä LC-MS/MS mahdollistavat modifikaatioiden kartoituksen ja kvantifioinnin. Pitkän aikavälin tavoitteena on ymmärtää mekanismit ja hyödyntää tieto terapeuttisina kohteina.