Päävariantti

Päävariantti on termi, jota käytetään kuvaamaan tilastollisesti eniten esiintyvää varianttia tietyssä kontekstissa tai datasetissä. Concept päävariantti riippuu siitä, mikä alue tai mikä ilmiö on tutkimuksen kohteena, ja se voi muuttua ajan mittaan väestön, esiintymisympäristön tai aineiston mukaan.

Kielitieteessä päävariantti viittaa usein sanan yleisimpään muotoon tai lemman (perusmuodon) näkökulmasta tärkeimpään varianttiin jossakin korpusdatan alueella. Esimerkiksi verbien taivutusvariaatioissa päävariantilla voidaan tarkoittaa yleisintä taivutusmuotoa, jota oikeus- ja kielikorpessa esiintyy suurin osa kerrroista.

Genetiikassa ja genomitietojen tutkimuksessa päävariantti tarkoittaa yksilöpopulaatiossa esiintyvää yleisintä alleelia, haplotypea tai todennäköisesti tapahtuvaa sekvensoriversiota. Päävariantin frekvenssi ilmoittaa, kuinka suuri osuus populaatiosta kantaa kyseistä varianttia. Eri populaatioissa päävariantti voi poiketa toisistaan, ja se voi ajan kuluessa muuttua esimerkiksi valintapaineiden tai migraation vuoksi.

Epidemiologiassa ja patogeenien seurannassa päävariantti voi viitata alueellisesti tai ajallisesti vallitsevaan kantaan tai linjaan. Tällainen käyttö löytyy sekä tieteellisissä julkaisuissa että uutisessa, mutta siitä käytetään yleensä täsmällisempää termistöä, kun kyse on viruksen luokittelusta ja evoluutiosta.

Päävariantin määrittäminen tapahtuu laskemalla varianttien frekvenssit ja valitsemalla suurimman esiintymisasteen omaava variantti. Usein raportoiankin sekä päävariantin että koko varianttijakauman, jotta kontekstin ja vaihtelun ymmärrys säilyy. Faasien mukaan päävariantti voi muuttua, jos uusi data tai väestönmuutos muuttaa taustalla olevaa jakaumaa.