Polyadenylationsstellen

Polyadenylationsstellen sind Positionen am 3'-Ende eukaryotischer Transkripte, an denen die Endbearbeitung der prä-mRNA erfolgt und anschließend eine Poly(A)-Kette angehängt wird. Typischerweise liegt stromaufwärts eine polyadenylation signal-Sequenz (AAUAAA oder eine Variante) etwa 10 bis 30 Nukleotide vor der eigentlichen Schnittstelle. Direkt stromabwärts folgt oft eine GU-/U-reiche Region, die die Endonuklease-Aktivität unterstützt. Nach dem Schnitt wird das Poly(A)-Tail durch die Poly(A)-Polymerase ergänzt.

Molekular betrachtet wird die Erkennung des Signals durch Faktoren wie CPSF und CstF koordiniert. Die Endonuklease-Cleavage erfolgt meist durch CPSF-73, gefolgt von der Additionsreaktion durch die Poly(A)-Polymerase. Das PABPN1 bindet am sich bildenden Tail und reguliert dessen Länge. Weitere Faktoren wie CFIm und CFIIm beeinflussen die Wahl der Polyadenylationsstelle und die Effizienz der Reaktion.

Alternative Polyadenation (APA) ermöglicht Transkripte mit unterschiedlichen 3'-UTRs oder sogar unterschiedlichen Kodierungen, was Stabilität, Transport und Translation beeinflusst. APA-Muster variieren nach Gewebe, Entwicklungsstadium und Stimulus und können mit Krankheiten wie Krebs oder neurologischen Störungen assoziiert sein. Nicht alle RNA-Typen tragen Poly(A)-Schwänze; Histon-mRNA besitzt eine andere Endverarbeitung. Die Identifikation von Polyadenylationsstellen erfolgt häufig durch 3'-End-Sequenzierungsmethoden wie PAS-Seq oder 3'READS.