Genombaserad

Genombaserad är ett adjektiv som används för att beskriva metoder, analyser eller designstrategier som baseras på information hämtad från genomet. Det avser angreppssätt som använder genomsekvenser, geninnehåll, strukturella kännetecken och genetisk variation för att informera beslut, klassificera prover eller styra interventioner. Delar av svenskt språkbruk använder termen inom livsvetenskaperna och relaterade fält.

I medicin används genombaserade strategier bland annat inom diagnostik och farmakogenomik, där patienters genomdata används för diagnos, prognos och behandling. Inom jordbruket används genom-baserad bredning och urval för att förbättra grödor och djur baserat på sekvensdata och variantinformation. Inom mikrobiologi och epidemiologi används genombaserad typisering och smittspårning för att avbilda evolution och åtgärda spridning av patogener.

Fördelar med genombaserade tillvägagångssätt inkluderar högre upplösning, möjligheten till personaliserade interventioner och bättre förståelse av genotype–phenotype-samband. Utmaningar är tolkning av stora och komplexa data, integritets- och etiska frågor, kostnader och behov av standardiserade metoder samt regleringsramar.

Begreppet hänvisar till en betoning på genom-data och kan väcka överväganden om samtycke, datasäkerhet och potentiell missbruk. Se även genomik, precisionsmedicin och bioinformatik.