F3geenissä

F3geenissä on suomalainen termi, jota käytetään geneettisessä kontekstissa kuvaamaan jotain, joka sijaitsee F3-geenin sisällä. Termi muodostuu geneettisestä nimekkeestä F3 ja suomen kielen paikannussuffixistä -ssä, jolla merkitään sijainti sisällä. Sitä käytetään, kun annotaatiossa viitataan esimerkiksi intragenisiin elementteihin, mutaatioihin, regulaatioelementteihin tai vaihtoehtoisiin silmukoihin ja muuttujiin, jotka sijaitsevat F3-geenin sisällä, toisin kuin alueet, jotka ovat geenin ulkopuolella tai välissä.

F3-geeni, ihmisellä tunnettu tissue factor -geeninä, koodaa kudosfaktorin, transmembraanisen glykopeptidin, joka toimii olennaisena kofaktorina veren hyytymisen extrinsikassa reitissä. Geenin rakenteeseen kuuluu eksoneita, introneita sekä 5'- ja 3'-untranslated region (UTR) -alueita sekä säätelyelementtejä, jotka kontrolloivat ilmentymistä. Ilmaukset kuten “mutaatio sijaitsee F3geenissä” tarkentavat, että kyse on intragenisestä, ei intergenisestä muutoksesta.

Tutkimuksessa ja kliinisessä annotaatiossa termillä F3geenissä voidaan erottaa intrageninen variation muusta genomisesta kontekstista. Se voi viitata yksittäisolukuisiin polymorfismeihin F3-geenin sisällä, insertioihin tai deleetioihin eksoneissa tai introneissa sekä regulaatio-seikkailuihin, jotka on koodin sisällä. Konsepti on analoginen vastaaville muille geeneille tarkoitetuille intragenisiä ominaisuuksia kuvaaville termeille.

Katso myös: Geeni, Exon, Intron, Regulatiivinen elementti, Tissue factor.