CpGdinukleotideilla
CpG dinukleotideilla on yhdistelmä kahta nukleotidia, sytosiinia (C) ja guaniinia (G), jotka sijaitsevat DNA-ketjussa peräkkäin. Nämä nukleotidisekvenssit ovat tärkeitä biologisissa prosesseissa, erityisesti nisäkkäiden genetiikassa. Luonnollisessa DNA:ssa sytosiinin metylaatio on yleistä, ja metyloitu sytosiini voi esiintyä epästabiilina ja muuttua spontaanisti tymiiniksi (T). Tämän seurauksena CpG-dinukleotidien esiintymistiheys DNA:ssa on huomattavasti pienempi kuin tilastollisesti odotettaisiin, jos satunnaisuus vallitsisi.
Näitä harvinaisia CpG-dinukleotideja esiintyy kuitenkin tietyillä alueilla DNA:ssa, joita kutsutaan CpG-saariksi. Nämä saaret ovat usein geenien
CpG-dinukleotidien tunnistaminen ja niiden metylaatiotila ovat tärkeitä työkaluja monissa molekyylibiologisissa sovelluksissa, kuten syövän diagnostiikassa ja kehityksestä