viitegeenin

Viitegeeni (engl. *reference gene*) on geen, jota käytetään molekyylibiologisissa tutkimuksissa referenssipisteenä geneettisen ilmentymisen (ekspressio) tutkimuksessa. Viitegeenien avulla voidaan normalisoida ja verrata eri näytteiden välisiä geneettisen ilmentymisen eroja, kuten esimerkiksi RT-qPCR-menetelmässä. Niiden tarkoituksena on kompensoida näytteen laadun, RNA:n laadun ja määrän sekä muiden tekijöiden, kuten entsyymien aktiivisuuden, vaihteluita.

Viitegeenit valitaan yleensä sellaisiksi, joiden ekspressio on vakaa tai lähes muuttumaton tutkittavissa olosuhteissa. Yleisiä viitegeenejä ovat esimerkiksi *GAPDH* (glyseraldehydi-3-fosfaattidehydrogenaasi), *ACTB* (beta-aktiini), *18S rRNA* ja *HPRT1* (hypoksantiinifosforibosyltransferaasi). Valinta riippuu tutkittavasta kudoksesta, organismista ja tutkimuskysymyksestä, sillä jotkin geenit voivat vaihdella esimerkiksi sairauksien tai kehitysvaiheiden mukaan.

Viitegeenien valinta on tärkeää, sillä huonosti valitut geenit voivat vääristää tuloksia. Siksi tutkijat käyttävät usein useita viitegeenejä ja vertailevat niiden stabiilisuutta ennen lopullisen valinnan tekemistä. Viitegeenien ekspressio mitataan samalla tavalla kuin tutkittavat geenit, ja tulokset normalisoidaan niiden keskiarvon tai geometrisen keskiarvon avulla.

Viitegeenien merkitys korostuu erityisesti sairauksien, lääkeaineiden vaikutusten ja kehitysvaiheiden tutkimuksessa, missä geneettisen ilmentymisen tarkat vertailut ovat olennaisia. Niiden käyttö varmistaa tulosten luotettavuuden ja helpottaa tulkintaa.