serotyyppiyettävissä

Serotyyppiyettävissä tarkoittaa bakteerikannan kykyä määrittää sen serotyyppi käyttämällä serologisten tyypityksen menetelmiä. Kyky riippuu bakteerin pinnan antigeeneistä, joita ovat tyypillisesti O- ja H-antigeenit sekä joillakin lajeilla kapseliantigeenit. Perinteinen serotyypitys käyttää spesifisiä vasta-aineita (antisera) ja niiden kanssa suoritettavia agglutinaatio- tai muita serologisia reaktioita, joista tuloksena saadaan serotyypin nimitys. Esimerkkejä: Salmonella enterica (Kauffmann-White -järjestelmä), Streptococcus pneumoniae -kaspelit, Escherichia coli -O- ja H-tyypit sekä Neisseria meningitidis -kapselityypit.

Monet kannot ovat tyypitettävissä, mutta osa bakteereista on non-typable eli ei serotyypitettavissa käytettävien reaktioiden puutteen tai epäselvien tulosten vuoksi. Rajoitteita ovat antigeenien faasimuutokset, ilmentymisen vaihtelut sekä ristireaktiot spesifisten antiseraiden kanssa, sekä kulttuurin laadun vaikutus.

Nykyaikaisessa laboratoriossa molekyylityypitys tukee tai täydentää perinteistä serotyypitystä. Koko-genomin sekvensointi ja PCR-pohjaiset serotyypityksen ennusteet voivat antaa serotyyppitiedon riippumatta ilmentymisestä. Esimerkkejä työkaluista ovat Salmonella-tyypittymiseen liittyvät ohjelmistot kuten SerotypeFinder ja SISTR. Serotyyppiyttämisellä on merkittävä rooli epidemiologisessa seurannassa, tautien seurantajärjestelmissä sekä rokotteiden suunnittelussa ja arvioinnissa.