filogenetík

Filogenetika je vědní disciplína zkoumající evoluční vztahy mezi organismy a jejich historii. Cílem je rekonstruovat evoluční stromy, které vyjadřují příbuznost druhů a jejich společné předky. Filogenetika integruje morfologické znaky, molekulární data a paleontologické záznamy s cílem pochopit vývoj života.

Zdroje dat zahrnují morfologické znaky a anatomii, sekvence DNA, RNA a proteinů, a také fosilní materiál. Mezi klíčové metody patří cladistika, parsimony, maximum likelihood a Bayesian inference. Pro odhad času divergencí se často používají molekulárně-časové metody a kalibrace fosiliemi. Výsledkem jsou filogenetické stromy a definované vztahy mezi různými skupinami organismů.

Historie a koncepce: Základy položil Willi Hennig ve 20. století, který zdůraznil sdílené odvozené znaky a monofyletické klady. S rozvojem molekulárních dat a výpočetních metod se filogenetika stala standardem v systematice. Termín zahrnuje jak tradiční morfologickou filogenetiku, tak moderní molekulární phylogeny a taxonomickou filogenetiku.

Aplikace a omezení: Filogenetika se uplatňuje v systematice, biogeografii, ekologii, medicíně a studiu evoluce patogenů. Omezují ji nejistoty v datech, horizontální přenos genů u mikroorganismů, neúplný fosilní záznam a kalibrace molekulárních hodin; výsledky jsou modelově citlivé a závisí na použitých datech a modelech.