Viirusluokitus

Viirusluokitus on tieteellinen järjestelmä, jonka avulla virukset ryhmitellään ja nimetään niiden sukulaisuussuhteiden perusteella. Kansainvälinen ICTV (International Committee on Taxonomy of Viruses) vastaa virusten taksonomian ylläpidosta ja päivittämisestä uusien geenitutkimusten sekä fenotyyppisten ominaisuuksien valossa. Nykyinen luokitus käyttää hierarkiaa, jonka tasoja ovat realm, phylum, class, order, family, genus ja species, sekä tarvittaessa alaluokkia (kuten subfamilies ja subgenera) ja lajien sisäisiä muotoja (kantoja).

Luokituksen peruspilareita ovat genomin tyyppi (DNA vs RNA; ds vs ss), replikaatiostrategia sekä virionin rakenne ja lipidikalvo. Lisäksi tarkastellaan isäntäryhmää, geneettisiä suhteita sekä fenotyyppisiä piirteitä. ICTV hyödyntää sekä genomi- että fenotyyppisiä tietoja määrittäessään läheisyyssuhteet ja nimityksen.

Esimerkkejä yleisistä famileistä ovat Coronaviridae, Herpesviridae, Flaviviridae ja Filoviridae. Esimerkiksi SARS-CoV-2 kuuluu Coronaviridae-heimoon ja Betacoronavirus-sukuun.

Viirusluokitus tukee tutkimusta, diagnostiikkaa, rokotekehitystä ja epidemiologista seurantaa. Se on jatkuvasti päivittyvä prosessi, joka reagoi uusien virusten ilmestymiseen sekä saatavilla olevan genomi- ja fenotietojen kehitykseen.