Nterminuksesta

Nterminuksesta viittaa proteiinin tai peptidin amino-terminaaliin, eli sen ensimmäiseen päähän, jossa on vapaa amino-ryhmä. Tämä pää määrittää polypeptidin alkuosan ja usein toimii lähtökohtana proteiinisynteesille sekä monille N-terminaalisille modifikaatioille ja prosesseille.

Syntesissä aloitus tapahtuu ribosomeissa, kun proteiini alkaa muodostua aloitus-kodonin lukemisesta. Eukaryooteissa aloitusmetioniini (Met) lisätään N-terminaaliksi, ja sen poistuminen riippuu seuraavasta aminohaposta. Joissain tapauksissa aloittava Met säilyy lopullisessa proteiinissa. Bakteereissa aloitus on usein formyloitu Met, jota voidaan poistaa myöhemmin. Näiden prosessien lopputulos on proteiinin lopullinen N-terminus.

N-terminaaliset modifikaatiot kattavat muun muassa N-terminaalisen asetylaation, joka tapahtuu cotranslationalisesti ja jonka suorittavat N-terminaaliyhdistysten entsyymit. Tämä modifikaatio vaikuttaa proteiinin vakauteen, vuorovaikutuksiin ja sub-solunaariseen lokalisaatioon sekä voi ohjata proteiinien elinkaarta.

Signaalit ja käsittely: N-terminaaliset signaaliproteiinit ohjaavat proteiinin eritettäväksi ER-järjestelmään tai muille organelleille. Tällaiset signaalit voivat tulla poistetuiksi tai käsiteltäviksi prosessoinnin aikana, jolloin syntyy ern lopullinen, yleensä lyhyt, N-terminaali.

Tutkimus ja mittaukset: N-terminaaleja tutkitaan N-terminomics-lähestymistavilla. Historiallisesti Edmanin degradaatio on ollut tärkeä menetelmä, mutta nykyisin massa-spektrometria ja erityiset näytteiden esikäsittelymenetelmät ovat valtaenemmistö tutkimuksissa. N-terminaaleilla on keskeinen rooli proteiinien toiminnassa, vakautumisessa ja elimistön proteolyyttisissä poluissa.