Nglykosyleringssekvens

Nglykosyleringssekvens är den specifika aminosyrsekvensen i ett polypeptid som används som mål för N‑glykosylering av proteiner. Den generella consensussekvensen är Asn‑X‑Ser/Thr (N‑X‑S/T), där X inte är prolin. Varje nysyntetiserat polypeptid som transloferas in i endoplasmatiska retikulumet (ER) kan få ett N‑länkad oligosackarid till Asn i denna sekvens av enzymkomplexet oligosackariltransferas (OST).

Den tillförda oligosackariden är vanligtvis Glc3Man9GlcNAc2 och genomgår snabb nedtrimming av glukos- och mannosdelar under bearbetningen. Denna initiala glykosylation följs av kvalitetskontroll i ER, där kalnexin och kalretikulin fungerar som veckningskåpar och bildar en cykel som övervakar korrekt veckning och stabilitet innan proteinet transporteras vidare till Golgiapparaten. N‑glykosylation påverkar proteinstabilitet, veckning, veckningstidsramar och cellens proteintrafik samt kan bidra till immune concealment hos vissa virus- och cellulära proteiner.

Det finns viktiga begränsningar: inte alla N‑X‑S/T‑motiv glykolyleras. X får inte vara prolin, och den omgivande strukturen samt tillgänglighet för OST påverkar glykolyleringens sannolikhet. N‑glykosyleringsplatser kan skapas eller förstöras av mutationer, och förutsägelser görs med bioinformatiska verktyg samt empiriska metoder som masspektrometri. Broschyren används ofta i studie av proteomik, sjukdomar som kongenital glyko­sylationsstörning och i analys av virala glycoproteiners biologiska funktion.