tieteessämerktoimista

Tieteessä merktoimista tarkoittaa merkintöjen, annotaatioiden ja muun vastaavan toiminnan harjoittamista tieteellisessä työssä. Se kattaa sekä fyysisten näytteiden ja laitteiden merkitsemisen että digitaalisen datan ja tekstuaalisen materiaalin kuvaamisen ja räätälöinnin.

Merkintöjen tavoitteena on tallentaa olosuhteet, menetelmät, havainnot sekä konteksti siten, että työ on toistettavissa ja vertailtavissa. Hyvä merkintä tukee tutkimuksen läpinäkyvyyttä, datan taas löydettävyyttä ja uudelleenkäyttöä.

Esimerkkejä eri aloilta: biologisessa tutkimuksessa näytteiden etiketti ja barcode, tutkimuskuvien annotointi ja segmentointi; kemiallisessa työssä näytteiden tunnistus ja säilytysvihjeet; lääketieteessä kliinisten tietojen ja kuvien annotointi; genomiikassa geenien ja varianttien merkintä; tutkimusdatan annotointi ja metadata.

Käytännöt sisältävät metatietojen rakentamisen, kontrolloitujen sanastojen käytön sekä yksilöllisten tunnisteiden, kuten näyte- ja tutkimustunnisteiden, hallinnan. Kansainväliset periaatteet, kuten FAIR, korostavat tiedon löytyvyyden, saatavuuden, yhteentoimivuuden ja uudelleenkäytön merkitystä. Yhteistyössä huomioidaan myös yksityisyys ja eettiset näkökulmat.

Merktoiminta voi parantaa tutkimuksen vakautta, toistettavuutta ja datan elinkaarta, mutta siihen liittyy haasteita kuten terminologian hajaantuminen eri aloilla, annotaation subjektiviteetti ja resursointi. Historia- ja kehitys: Merkintöjen ja annotaatioiden harjoittaminen on ollut osa luonnontieteitä jo pitkään, ja digitalisaation myötä niistä on tullut keskeinen osa tutkimusaineiston hallintaa ja avointa dataa.