glykosylaatiopaikkoja

Glykosylaatiopaikkoja viittaa tiettyihin aminohappotähteisiin proteiinissa, joihin hiilihydraattimolekyylejä eli glykaaneja voidaan liittää. Tämä prosessi, jota kutsutaan glykosylaatioksi, on yksi yleisimmistä post-translaationaalista proteiinien muokkauksesta eukaryooteissa. Glykosylaatiolla on merkittävä vaikutus proteiinien rakenteeseen, toimintaan, stabiiliuteen ja solunsisäiseen kuljetukseen.

Yleisimpiä glykosylaatiopaikkoja ovat asparagiini (N-glykosylaatio) ja seriini tai treoniini (O-glykosylaatio). N-glykosylaatio tapahtuu tyypillisesti asparagiinin sivuketjun amidityppisessä typessä, kun asparagiini on osa tiettyä sekvenssiä, usein Asn-X-Ser/Thr, missä X on mikä tahansa aminohappo paitsi proliini. O-glykosylaatio puolestaan liittyy seriinin tai treoniinin hydroksyyliryhmään. On olemassa myös muita, harvinaisempia glykosylaatiotyyppejä, kuten C-mannosyltryptofaani.

Paitsi suorana aminohappotähteen sitoutumisena, glykosylaatiopaikkojen tunnistaminen proteiinissa on kriittistä sen oikeanlaisen toiminnan varmistamiseksi. Näiden paikkojen olemassaolo ja sijainti ovat ohjelmoituja proteiinin aminohappojärjestykseen. Glykosylaatiopaikkojen löytäminen ja analysointi ovat tärkeitä proteiinien biologisen roolin ymmärtämiseksi ja mahdollisesti uusien lääkeaineiden kehittämiseksi, jotka kohdistuvat tiettyihin glykosylaatioreitteihin.