Proteiinisekvenssissä
Proteiinisekvenssissä viittaa aminohappojen järjestykseen proteiinimolekyylissä. Tämä järjestys on määrätty geneettisesti DNA:n emäsparien järjestyksellä, joka transkriboidaan ensin lähetti-RNA:ksi ja translatoidaan sitten proteiiniksi. Aminohappojen lineaarinen järjestys proteiinissa tunnetaan primaarirakenteena. Primaarirakenteella on ratkaiseva merkitys proteiinin kolmiulotteisen rakenteen ja siten sen toiminnan määrittämisessä. Jos aminohappojen järjestys muuttuu, proteiinin rakenne ja toiminta voivat muuttua merkittävästi, mikä voi johtaa sairauksiin. Proteiinisekvenssin analyysi on tärkeä työkalu biologian ja lääketieteen tutkimuksessa, jotta voidaan ymmärtää proteiinien toimintaa, kehittää lääkkeitä ja tunnistaa geneettisiä muutoksia. Sekvenssitietojen vertailu eri eliöiden välillä auttaa myös selvittämään evolutiivisia suhteita. Proteiinisekvenssit tallennetaan ja niitä analysoidaan usein bioinformatiikan työkaluilla, kuten sekvenssialinmentusohjelmilla.