Peptidyylitransferaasientsyyminä

Peptidyylitransferaasientsyyminä viittaa entsyymiin, joka katalysoi peptidisidoksen muodostumista aminohappojen välille. Tämä on keskeinen reaktio proteiinien biosynteesissä, joka tapahtuu ribosomeissa. Erityisesti ribosomaalinen RNA (rRNA) on osoitettu toimivan peptidyylitransferaasiaktiivisuuden kantajana ribosomin suuressa alayksikössä. Tämä havainto on ollut merkittävä, sillä se osoittaa RNA-molekyylien kykenevän suorittamaan entsymaattisia tehtäviä, mikä tukee RNA-maailmateoriaa.

Peptidyylitransferaasireaktio liittyy aminohappojen liittämiseen kasvavaan polypeptidiketjuun. Kun aminohappo on kiinnittynyt siirtäjä-RNA:han (tRNA) ribosomin A-paikassa, peptidyylitransferaasientsyymi siirtää kasvavan peptidirakenteen, joka on kiinnittynyt P-paikassa olevaan tRNA:han, A-paikassa olevaan aminohappoon. Tämä muodostaa uuden peptidisidoksen ja pidentää polypeptidiketjua yhdellä aminohapolla. Tämä prosessi toistuu jokaisen uuden aminohapon liittymisen yhteydessä, kun ribosomi etenee lähetti-RNA:ta (mRNA) pitkin.

Ribosomin peptidyylitransferaasitoiminto on elintärkeä kaikille eläville organismeille. Monet antibiootit kohdistuvat nimenomaan bakteerien ribosomin peptidyylitransferaasiaktiivisuuteen, estäen siten bakteeriproteiinien synteesiä ja hidastaen tai pysäyttäen bakteerikasvun. Tämä entsyyminä toimiva rRNA-molekyyli on siis keskeinen kohde antimikrobisten lääkkeiden kehityksessä.