Kilobaseja

Kilobaseja (lyh. kb) on pituusyksikkö, jolla ilmaistaan DNA:n pituus suuremmissa mittakaavoissa. Yksi kilobase vastaa 1 000 emäsparia kaksijuosteisessa DNA:ssa (bp). Kun pituutta mitataan kaksijuosteisessa DNA:ssa, käytetään emäsparien määrää (bp); jos puhutaan yksittäisestä juosteesta, pituus voidaan ilmoittaa nukleotideina (nt). Yksi kilobase vastaa noin 1 000 bp, ja 1 megabase (Mb) vastaa 1 000 000 bp, eli noin 1 000 kb.

Käyttöalueet ja esimerkit: kb- yksikköä käytetään usein kuvaamaan DNA-fragmenttien, plasmidien ja kromosomien pituuksia sekä genominlaajuisten projektien tuloksia. Esimerkiksi bakteerien genomit ovat tyypillisesti muutamasta tuhansesta kilobaasista muutamaan sataankin tuhanteen kilobaasin pituuteen; Escherichia coli on noin 4,6 Mb, mikä vastaa noin 4 600 kb. Ihmisen haploidinen genomi on noin 3 000 Mb eli noin 3 000 000 kb. Pituuksia käytetään myös sekvensointiraporteissa ja kontigien tai contig- sekä vektoreiden suunnittelussa.

Termistö ja muuntaminen: kilobaseja voi kutsua myös kilobaasiksi; yleisimmin käytetään lyhentejä kb tai kbp. Kun mitataan kaksijuosteista DNA:ta, pituus ilmaistaan emäsparien määränä (bp), mutta suurissa mittayksiköissä käytetään kb-yksikköä. 1 kb = 1 000 bp; 1 Mb = 1 000 kb.