FISHtechnikák

FISHtechnikák a molekuláris cytogenetika módszerei, amelyek fluoreszcens címkével ellátott nukleinsav-probe-ok in situ hibridizációján alapulnak. Fixált sejtekben, kromoszómákon vagy szöveteken keresik meg a cél DNS- vagy RNS-szekvenciát; a probe komplementer szekvenciához kötődik, és a fluoreszcens jel a mikroszkópban láthatóvá válik. Ennek révén megállapítható a jelzett anyag helye, mennyisége és térbeli kapcsolata.

Fontosabb fajtái közé tartozik a DNS-FISH, amely DNS-szekvenciákat keres; az interphase- és metaphase-FISH a sejtminták csoportos állapotától függően alkalmazható; a multicolor FISH (M-FISH) vagy spektroszkópiai karyotyping (SKY) több kromoszómát különböző színekben ábrázol; a fiber-FISH a hosszú DNS-szálak részletes leképezésére szolgál; és az RNA-FISH, amely transzkriptumok lokalizációját mutatja. Ritkábban használt variáns a single-molecule RNA FISH (smFISH), amely egyetlen RNS-molekulák számolását teszi lehetővé.

A technikákat klinikai és kutatási területeken egyaránt alkalmazzák: onkológiában a kromoszómatranszlokációk, génduplikációk és más rearrangementek felderítésére; diagnosztikában mikrodeletálódások vagy copy-number változások kimutatására; valamint genomikai térképezésre és génexpressziós vizsgálatok helyi vizualizációjára. Előnyük, hogy vizuálisan is megfigyelhető a célterület, és több jelölés egyszerre is detektálható; hátránya a moderált felbontás, a speciális eszköz- és probe-igényesség, valamint a mintavétel és előkészítés igénye.