replikaatiohaaraa

Replikaatiohaara (replication fork) on DNA-replikoinnin aikana muodostuva Y‑muotoinen rakenne, jossa kaksijuosteinen DNA avautuu ja molemmat juosteet toimivat mallina uusien juosteiden synteesille. Replikaatio alkaa origosta, ja etenemisen myötä replikaatiohaarat etenevät vastakkaisiin suuntiin muodostaen kuplamaisen replikaatioalueen.

Replikaatiohaaran sisällä on useita keskeisiä proteiineja: helikaasi avaa juosteet, ja yksijuosteiset DNA:ta sitovat proteiinit suojaavat templaatteja. Primasi asettaa RNA-primereita, joiden päälle DNA-polymeraasi rakentaa uutta juostetta. Johtava juoste syntyy jatkuvasti 5'→3'-suuntaan, kun taas lagging-juoste muodostuu Okazaki-fragmenttien sarjana, jotka liitetään toisiinsa DNA-ligaasilla. Edellä kulkevan etenemisen yhteydessä topoisomeraasit purkavat eteen syntyvää ylikuormitusta.

Prokaryooteissa replikaatiohaara syntyy yleensä yhdestä origosta ja etenee bidirectionaalisesti. Eukaryooteilla origon määrä on suurempi, ja replikaatio tapahtuu useissa replikaatiopäätteissä useiden origon ympärillä.

Replikaatiohaaran dynamiikkaa säätelevät tarkistus- ja huoltojärjestelmät, ja replikaatiostressi voi pysäyttää replikaation tai käynnistää sen uudelleen, mikä on tärkeää genomisen vakauden kannalta.