proteiinisekvenssistä

Proteiinisekvenssi viittaa lineaariseen järjestykseen aminohappoja, jotka muodostavat proteiinin. Tämä järjestys on määritelty geneettisen koodin perusteella ja on kriittinen proteiinin kolmiulotteisen rakenteen ja toiminnan kannalta. Aminohappojen sideaineena on peptidisidos, ja sekvenssi luetaan tyypillisesti aminopäästä (N-termini) karboksyylipäähän (C-termini). Proteiinisekvenssin tunteminen on olennaista biologisten prosessien ymmärtämiseksi, sairauksien diagnosoinnissa ja uusien lääkkeiden kehittämisessä. Sekvenssianalyysi voi paljastaa proteiinin toiminnallisia alueita, kuten aktiivisia kohtia tai sitoutumissaiteitä. Erot proteiinisekvensseissä voivat johtua mutaatioista tai polymorfismeista, jotka voivat vaikuttaa proteiinin vakauteen tai aktiivisuuteen. Tieto proteiinisekvensseistä on tallennettu laajoihin tietokantoihin, kuten UniProt, ja sitä käytetään laajasti bioinformatiikassa. Proteiinisekvenssin määrittäminen on mahdollista menetelmillä kuten Edmanin degradaatio ja massaspektrometria. Proteiinisekvenssin ja sen rakenteen sekä toiminnan välinen suhde on keskeinen molekyylibiologiassa.