polypeptidiketjessä

Polypeptidiketjussa viittaa proteiinin rakenteelliseen perusyksikköön. Se on pitkä ketju aminohappoja, jotka ovat liittyneet toisiinsa peptidisidoksilla. Peptidisidos muodostuu, kun yhden aminohapon karbokyyliryhmä reagoi toisen aminohapon aminoryhmän kanssa vapauttaen vesimolekyylin. Tämä ketju on proteiinin ensisijainen rakenne. Aminohappojen järjestys tässä ketjussa määräytyy geenin informaation perusteella ja on ratkaisevan tärkeä proteiinin lopullisen kolmiulotteisen rakenteen ja toiminnan kannalta. Polypeptidiketju voi olla lyhyt, koostuen vain muutamasta aminohaposta, tai erittäin pitkä, sisältäen satoja tai jopa tuhansia aminohappoja. Yhden tai useamman polypeptidiketjun laskostuminen ja mahdollinen vuorovaikutus muiden molekyylien kanssa muodostaa toiminnallisen proteiinin. Ketjun päädyt tunnetaan N-terminuksena (aminopää) ja C-terminuksena (karboksyylipää), jotka määrittelevät ketjun suunnan. Polypeptidiketjun taittuminen tapahtuu usein spontaanisti, mutta sitä voi ohjata apuna olevat molekyylit.