kantaisäpopulaatiosta

Kantaisäpopulaatio on termi populaatiogenetiikassa, joka kuvaa menneisyyden populaatiota, josta nykyisten yksilöiden perimä polveutuu. Se on usein hypoteettinen ja tilallinen käsite, jota käytetään erityisesti koalesenssiteoriassa ja filogeografiassa.

Koalesenssiteorian mukaan geenilinjat voivat suuntautua ajassa taaksepäin, kunnes ne kohtaavat yhteisen kantaisäpopulaation. Tämä kohtaaminen määrittelee viimeisen yhteisen kantaisäpopulaationin (MRCA). Kantaisäpopulaation koon ja rakenteen historia vaikuttavat siihen, miten nopeasti MRCA voidaan löytää ja millaisia aikaskaaloja voidaan odottaa.

Käyttötarkoitukset: Kantaisäpopulaatioita käytetään demografisen historian estimoinnissa, esimerkiksi populaation koon muutosten, eriytymisen, siirtolaisuuden ja sekoittumisen tutkimuksessa. Ihmisen geneettisissä tutkimuksissa mallinnetaan usein kantaisäpopulaatioita, joiden kautta nykyistä monimuotoisuutta selitetään suuremmissa kokonaisuuksissa.

Rajoitteet: Kantaisäpopulaatio on malli, ja todelliset populaatiot ovat rakenteellisesti monimutkaisempia. Oletukset, kuten populaation koon pysyvyys ja yhtenäinen rakenne, voivat olla virheellisiä; siksi MRCA:n ajoitus ja kantaisäpopulaation historia ovat epävarmoja ja riippuvat käytetystä mallista.