Cterminaalisen

Cterminaalinen, tai C-terminaalinen pääte, on termi, jota käytetään kuvaamaan proteiineissa tai peptideissä sijaitsevaa karboksyyliryhmään liittyvää loppua — loppupäätä, joka on vastakohta N-terminukselle. C-terminaali koostuu proteiinin tai peptidin viimeisestä aminohappoosiosta ja sen vapaa karboksyliryhmä vaikuttaa proteiinin biokemiallisiin ominaisuuksiin sekä sen mahdollisiin posttranslatoituihin modificaatioihin.

C-terminaaliset ominaisuudet voivat vaikuttaa proteiinin vakauteen, alustus- ja paikallistumisominaisuuksiin sekä protein-protein- vuorovaikutuksiin. Joillakin proteiineilla C-terminaaliyhteys toimii tunnistus- tai kohdistumis-signaalina. Esimerkkinä peroksisomien kohdentumissignaalit PTS1, jotka sijaitsevat C-terminaalissa ja koostuvat yleisestä kolmen(aminohapon) jaksosta kuten SKL, ohjaten proteiinia peroksisomiputkea kohti. Lisäksi C-terminaaliset motifit voivat vaikuttaa sitoutumiseen PDZ-entsyymeihin ja muihin signaalikekosysteemeihin.

Bioteknologiassa C-terminaalisilla proteiinitagauksilla (esimerkiksi His-, FLAG- tai GFP-tagit) voidaan suojattua proteiinia puhdistaa ja tunnistaa. Tagi voidaan liittää C-terminaaliin tai N-terminaaliin riippuen proteiinin toiminnasta ja ilmentymisjärjestelmästä; usein käytetään proteaasin leikkaamaan tagi pois, jolloin proteiinien toiminnallinen C-terminaali palautuu.

analysointi ja kartoitus: N- ja C-terminusten tutkimiseen käytetään massaspektrometriaa sekä erikoismenetelmiä kuten C-terminomics; perinteinen Edmanin menetelmä antaa pääasiassa tietoa N-terminuksesta, kun taas C-terminaaliset loput voivat vaatia erityisiä lähestymistapoja.

Yhteenvetona C-terminaalisuus on keskeinen käsite proteiineissa ja peptidesissä, joka liittyy sekä rakenteellisiin että toiminnallisiin ominaisuuksiin sekä tutkimus- ja sovelluskonteksteihin.