viirusliikidele

Viirusliikide mõiste on viroloogia taksonoomia keskne. Viirusliik on viiruste rühm, mille liikmed jagavad ühist geneetilist pärandit ning sarnaseid ökoloogilisi omadusi. Liikide vahelised erinevused võivad ilmneda hosti valikus, haiguslikus käitumises ja genoomilises koostises. Viirusliikide nimed ning klassifikatsioon koostatakse Rahvusvahelise Viirusklassifikatsiooni Komitee (ICTV) poolt ning need võivad uute andmete valguses muutuda.

Taksonoomias on viirusliik aluslik rühm, mille liikmed on geneetiliselt väga sarnased ning jagavad sarnaseid replikatsiooniliste ja ökoloogilisi omadusi. Liikide demaratsioon põhineb mitmete kriteeriumide koosmõjul: genoomi järjestuse identiteet, proteiinide sarnasused ning ökoloogilised omadused, sealhulgas host ja haiguslikud tunnused. ICTV kasutab erinevates viirusrühmades erinevaid norme ning need võivad aja jooksul muutuda.

Näited viirusliikidest hõlmavad HIV-1 ja HIV-2, mis nakatavad inimesed. Teine näide on Severe acute respiratory syndrome–related coronavirus liiki kuuluv viirus, mille esindaja on SARS-CoV-2. Viirusliikide nimede ja klassifikatsiooni reeglid arenevad pidevalt, seetõttu on oluline viidata ICTV viimastele väljaannetele.

Määratlemine ja jälgimine on olulised haiguste jälgimisel, vaktsiinide ja diagnostika arendamisel. Viirusliikide klassifikatsioon võimaldab teadlastel ja tervishoiuorganisatsioonidel ühtse keele alusel kirjeldada ning võrrelda nakkushaiguste mustreid.