remodelatsioonikomplexid

Remodelatsioonikompleksid on ATP-d kasutavad mitmekordsed valgukompleksid, mis muundavad kromatiini pakendit, et reguleerida DNA ligipääsetavust. Need kompleksid on kriitilised geenide ekspressiooni kontrollimisel, DNA parandamisel ning rakujagunemisel ja arengus.

Peamised perekonnad on SWI/SNF, ISWI, CHD, INO80 ja SWR1. Iga perekond sisaldab katalüütilist ATPaasi-alamühikut ja mitmesuguseid reguleerivaid alamühikuid. SWI/SNF-katvate komplektid (inimorganismides tuntud kui BAF ja PBAF) aitavad koos transkratsioonifaktoritega muuta nucleosome’i paigutust ning ligipääsetavust DNA-le.

Mehhanism: ATP-hüdrolüüs annab energiat, et liigutada või ümber korraldada nucleosomeid, tekitades tugevama või nõrgema DNA ligipääsu. SWR1-kongregaat viib histooni H2A.Z-variantide vahetuse, samas ISWI ja CHD perekonnad tekitavad erinevat tihenduse ja paigutuse mustriteid.

Rollid: remodeling-kompleksid osalevad geenide ekspressiooni kontrollis, arengus ja diferentseerumises, DNA paranduses ning genoomi stabiilsuse tagamises. Nad on sageli rekruitideeritud transkriptsioonifaktorite ja teiste kromatiini modifikaatorite poolt ning nende tegevust mõjutavad histoonide modifikatsioonid ja DNA-täitumine.

Kliiniline tähtsus: remodelatsioonikomplekside mutatsioonid on seotud paljude haigustega, eriti erinevate kasvajate puhul (näiteks SMARCA4/BRG1 ja ARID1A mutatsioonid) ning neid seostatakse ka neurodevelopmental häiretega. Need komplekssed moodustavad potentsiaalseid terapeutilisi sihtmärke ning nende mõistmine on oluline genoomse regulatsiooni ja haiguste uuringus.