proteiinidomeeneja

Proteiinidomeenit ovat erillisiä, vakaasti laskostuneita osia proteiinista, jotka voivat toimia itsenäisesti tai yhdessä muiden domeenien kanssa. Ne ovat proteiinin rakenteen ja toiminnan perusyksiköitä. Usein yhden proteiinin monimuotoisuus ja tehtävät johtuvat eri domeenien yhdistelmästä.

Domeenit voivat olla rakenteellisesti samankaltaisia eri proteiineissa, mikä viittaa yhteiseen evolutiiviseen alkuperään ja toiminnalliseen rooliin. Tämä ilmiö tunnetaan "domeenien uudelleenkäyttönä" evoluutiossa. Tunnistamalla proteiinin domeenit voidaan usein päätellä sen mahdollisesta tehtävästä tai vuorovaikutuksista muiden molekyylien kanssa. Esimerkiksi DNA:ta sitovat domeenit ovat yleisiä proteiineissa, jotka säätelevät geenien ilmentymistä.

Domeenien löytäminen ja tunnistaminen perustuu usein proteiinien kolmiulotteisen rakenteen analysointiin röntgenkristallografian tai NMR-spektroskopian avulla. Bioinformatiikan työkalut, jotka vertailevat aminohapposekvenssejä ja ennustavat proteiinien rakennetta, auttavat myös domeenien tunnistamisessa, vaikka proteiini ei olisikaan vielä rakenteellisesti määritelty. Proteiinidomeenien ymmärtäminen on keskeistä proteiinien toiminnan, vuorovaikutusten ja mahdollisten sairauksien tutkimuksessa.