bioinformaatikat

Bioinformaatika on interdistsiplinaarne teadusharu, mis ühendab bioloogiat, informaatikat ja matemaatikat. Selle peamine eesmärk on analüüsida ja tõlgendada bioloogilist infot suurte andmemahtude kaudu ning luua tööriistu ja meetodeid bioloogiliste süsteemide mõistmiseks ning nende toimimise mudeldamiseks.

Valdkond hõlmab geneetika ja genoomika, transkriptoomi ja proteoomika andmete töötlemist, valkude struktuuride ja funktsioonide modelleerimist ning süsteemibioloogiat. Uuritakse seoseid, ennustatakse fenotüüpe ja püüeldakse parema arusaamani bioloogiliste protsesside dünaamikast.

Olulised meetodid ja tööriistad hõlmavad järjestuste analüüsi (Needleman–Wunsch, Smith–Waterman), kiireid otsinguid (BLAST, DIAMOND), genoomi kokkupanekut ja annotatsioonide lisamist, proteiinistruktuuride modelleerimist ning statistilist ja masinaõppepõhist andmeanalüüsi. Programmeerimisel kasutatakse peamiselt Pythonit ja R-i, Bioconductorit ning BioPythonit. Andmebaasid nagu GenBank, EMBL, UniProt ja ENCODE pakuvad ulatuslikke bioloogilisi andmekogumeid.

Rakendused hõlmavad meditsiini ja personaliseeritud meditsiini, ravimite ja biotehnoloogia arendust, põllumajandust ning ökoloogia ja evolutsiooniuuringuid.

Haridus ja karjäär: bioinformaatika aluseid õpetatakse ülikoolides ning magistri- või doktoriõppe raames. Tööd tehakse nii akadeemilises kui tööstuslikus sektoris, kus on vaja suurandmete analüüsi ja bioloogilise informatsiooni tõlgendamise oskusi.

---