RNAmodifikaatioiden

RNAmodifikaatiot ovat RNA-molekyylien kemiallisia muutoksia, jotka tapahtuvat transkription jälkeen ja vaikuttavat RNA:n toimintaan. Ne esiintyvät erityisesti tRNA:ssa ja rRNA:ssa, mutta myös mRNA:ssa sekä pienissä RNA-ryhmissä kuten snRNA:ssä ja snoRNA:ssa. Yleisimmät modifikaatiot ovat N6-metylaadenosiini (m6A), 5-metycytosiini (m5C), pseudouridiini (ψ), 2'-O-metyylöinti (Nm), sekä tRNA:n ja rRNA:n lisämuutokset kuten m1A ja s2U. Modifikaatiot voivat olla dynaamisia ja niiden kirjoittajiksi, lukiiksi ja poistajiksi toimivat proteiinit säätelevät RNA:n rakennetta, sen vakautta, splicingia, vieraiden RNA:n tunnistamista sekä käännöksen tehokkuutta.

Modsikaatioiden kirjoittajat, poistajat ja lukijat muodostavat epitranskriptionaalisen koodin. Esimerkiksi m6A-modifikaation koodausta ohjaavat kirjoittajat kuten METTL3/METTL14 (m6A), ja pseudouridinylaatioissa toimivat pseudouridin-syntaasi-entsyymit. Poistajat kuten demetylaasi FTO ja ALKBH5 voivat muuttaa m6A:n takaisin adeniin, mikä tekee modifikaatioista dynaamisia. Lukijakansioihin kuuluvat YTH-proteiinit ja muut sitoutuvat tiettyihin modifikaatioihin vaikuttaen RNA:n kohtaloon solussa.

Merkitys ja sovellukset: RNA-modifikaatiot säätelevät RNA:n kykyä löytää ribosomirakenteita, sen vakautta ja käännöksen määrää sekä splicingia ja subsolujen viettelyä. Niiden rooli on erityisen tärkeä kehityksessä, stressivasteissa ja sairauksissa, kuten syövässä ja neurologisissa tiloissa. Tutkimuksessa käytetään esimerkiksi MeRIP-seq-/miCLIP-tyyppejä m6A-tunnistukseen, pseudouridini-sekventointia sekä suoranaislukemisia nanopore-teknologialla modifikaatioiden havaitsemiseksi.